在抗日战争中，作为新四军的首脑机关，军部曾经多次搬迁，1943年初，它又从江苏盐城搬迁到安徽盱眙县黄花塘，直至抗战胜利。
那么，新四军军部为什么要搬迁呢？
1941年皖南事变后，国内外军事形势处于激烈动荡和急剧变化之中。日军向美国开战，挑起太平洋战争，但兵力不敷分配，在华中地区尚保留了14个师团、独立混成旅团，约29万人。
在日伪顽夹击下，新四军主力损失较大。苏南、淮南抗日根据地面积缩小，豫皖苏边根据地被迫放弃，华中敌后抗战进入极其艰难困苦的时期。
为此，陈毅等人致电党中央，提出新四军向西移动，以皖东为基础，沿长江两岸向西发展。
关于军部设在何处，陈毅等人认为，盐城地势平坦，南、北、西三面处于日伪势力范围，且东临黄海，不利隐蔽，易暴露目标，如日军重兵来犯，军首脑机关作战回旋余地小，在紧急情况下无退路。
为此，陈毅等人对军部驻地考虑了几套方案：
一是北上鲁南。
鉴于日军正大举“扫荡”山东省，新四军北上难免与“扫荡”日军相撞，于我不利。
二是南下苏中。
苏中亦处于日军大“扫荡”圈内，如一着不慎，很有可能造成指挥中断，南下亦非上策。
三是向西，经淮南、路东、路西到巢无。
几个方案相比较，以向西为宜。但，向西也有不足之处，即，在紧急情况时军部远离新四军1、2两个主力师。
为此，华中局及军部商定：华中局机关及赖传珠、谭震林率部向西转移；陈毅及军部机关在苏北随1、3两师行动；彭康率一批干部经苏南去浙东。后因情况发生突然变化，遵照中共指示，新四军军部决定，1师负责抗击敌多路进攻，军部和华中局均由苏北转移到淮南路东的盱眙县黄花塘。
1942年12月25日，华中局和新四军军部机关及直属队分成三个梯队，从阜宁地区西移，于1943年1月10日抵达黄花塘。
黄花塘位于淮南抗日根据地的中心，原为新四军2师师部驻地，是一个平常而不显眼的小村庄。作为新四军的军部有其得天独厚的有利条件：
一是地理位置适中。
黄花塘地处淮南盱眙县，位于华中腹地。该地在长江、淮河之间，东临大运河，西望大别山，是华北八路军和江南新四军联系的纽带地区，又是联系华中各抗日根据地的中枢地域。加之该地区扼津浦、淮南，与日军中国派遣军总司令部驻地和汪伪政府首都南京隔着大江。
日军侵占津浦铁路南段后，淮南被分割为路东、路西两大片，日军因兵力不足而占据县城和交通沿线的较大集镇，无力深入地形复杂的内地建据点，铁路两边十几公里以外的广大农村均为解放区，既便于部队立足。
二是群众基础好。盱眙是革命老区，有良好的群众基础，又得到进一步发展。
三是自然条件有利。盱眙地属丘陵，东边有三河，西边有淮河，北面有洪湖，既有丘陵、山冈，又有平原、圩区，还有大片的树林，可谓是天然屏障。此外，该地区较为富饶，有较殷实的人力、财力和物力资源，为我军作战和实施财务保障的基础。
结果，新四军军部在日伪顽的夹击中，常驻黄花塘达两年零八个月之久，直至抗战胜利。
